Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms