Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNAPC1Q16533 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNAPC1Q16533 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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