Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMCHL1Q16048 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms