Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCN9AQ15858 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN9AQ15858 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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