Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NEDD8Q15843 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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