Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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TAF11Q15544 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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TAF11Q15544 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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TAF11Q15544 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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TAF11Q15544 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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TAF11Q15544 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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TAF11Q15544 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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TAF11Q15544 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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TAF11Q15544 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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TAF11Q15544 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TAF11Q15544 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms