Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PDK3Q15120 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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