Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERC3Q15034 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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