Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FRMPD4Q14CM0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD4Q14CM0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD4Q14CM0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD4Q14CM0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD4Q14CM0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD4Q14CM0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD4Q14CM0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD4Q14CM0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD4Q14CM0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD4Q14CM0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD4Q14CM0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD4Q14CM0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD4Q14CM0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD4Q14CM0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD4Q14CM0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD4Q14CM0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD4Q14CM0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD4Q14CM0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD4Q14CM0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD4Q14CM0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD4Q14CM0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FRMPD4Q14CM0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms