Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHPRHQ149N8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHPRHQ149N8 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
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