Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CAPSQ13938 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms