Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EXOSC2Q13868 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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