Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TUBA3CQ13748 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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