Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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