Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CUL1Q13616 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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CUL1Q13616 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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CUL1Q13616 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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