Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC1Q13547 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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