Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATMQ13315 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATMQ13315 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATMQ13315 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATMQ13315 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATMQ13315 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATMQ13315 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATMQ13315 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATMQ13315 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATMQ13315 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATMQ13315 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATMQ13315 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATMQ13315 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATMQ13315 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATMQ13315 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATMQ13315 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATMQ13315 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATMQ13315 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATMQ13315 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATMQ13315 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATMQ13315 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATMQ13315 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATMQ13315 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATMQ13315 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATMQ13315 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATMQ13315 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATMQ13315 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATMQ13315 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATMQ13315 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATMQ13315 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATMQ13315 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATMQ13315 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATMQ13315 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMQ13315 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMQ13315 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMQ13315 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMQ13315 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMQ13315 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMQ13315 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMQ13315 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMQ13315 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMQ13315 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMQ13315 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMQ13315 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMQ13315 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMQ13315 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMQ13315 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMQ13315 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMQ13315 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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