Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRSF6Q13247 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRSF6Q13247 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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