Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAF1AQ13111 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
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