Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IFT88Q13099 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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