Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRDNQ13061 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms