Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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