Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF1Q12946 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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FOXF1Q12946 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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FOXF1Q12946 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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