Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPTFQ12830 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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