Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMARCB1Q12824 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMARCB1Q12824 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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