Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

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Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCAPQ12770 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCAPQ12770 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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