Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms