Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
C2orf54Q08AI8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms