Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN11Q06124 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN11Q06124 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms