Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms