Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms