Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
IRF8Q02556 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms