Protein–RNA interactions for Protein: Q02338

BDH1, D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDH1Q02338 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BDH1Q02338 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms