Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BNC1Q01954 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms