Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SPIBQ01892 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIBQ01892 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms