Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1DQ01668 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms