Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms