Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRX3P78415 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRX3P78415 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRX3P78415 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
IRX3P78415 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRX3P78415 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRX3P78415 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRX3P78415 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRX3P78415 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRX3P78415 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRX3P78415 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRX3P78415 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRX3P78415 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRX3P78415 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRX3P78415 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRX3P78415 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRX3P78415 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRX3P78415 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRX3P78415 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX3P78415 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX3P78415 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX3P78415 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX3P78415 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX3P78415 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX3P78415 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX3P78415 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX3P78415 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX3P78415 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX3P78415 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX3P78415 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX3P78415 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX3P78415 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX3P78415 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX3P78415 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX3P78415 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX3P78415 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX3P78415 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX3P78415 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX3P78415 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX3P78415 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX3P78415 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX3P78415 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX3P78415 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX3P78415 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRX3P78415 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRX3P78415 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRX3P78415 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRX3P78415 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRX3P78415 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRX3P78415 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRX3P78415 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRX3P78415 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRX3P78415 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRX3P78415 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRX3P78415 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRX3P78415 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRX3P78415 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRX3P78415 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRX3P78415 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRX3P78415 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRX3P78415 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRX3P78415 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRX3P78415 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRX3P78415 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRX3P78415 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX3P78415 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX3P78415 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX3P78415 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX3P78415 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX3P78415 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX3P78415 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX3P78415 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX3P78415 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX3P78415 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX3P78415 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX3P78415 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX3P78415 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX3P78415 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX3P78415 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX3P78415 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX3P78415 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX3P78415 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX3P78415 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX3P78415 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX3P78415 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX3P78415 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX3P78415 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX3P78415 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX3P78415 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX3P78415 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX3P78415 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX3P78415 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX3P78415 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX3P78415 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX3P78415 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRX3P78415 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRX3P78415 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRX3P78415 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRX3P78415 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRX3P78415 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms