Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS4XP62701 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms