Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNRPD2P62316 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms