Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB38P57729 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB38P57729 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB38P57729 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB38P57729 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB38P57729 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB38P57729 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB38P57729 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB38P57729 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB38P57729 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB38P57729 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB38P57729 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB38P57729 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB38P57729 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB38P57729 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB38P57729 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB38P57729 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB38P57729 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB38P57729 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB38P57729 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB38P57729 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB38P57729 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB38P57729 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB38P57729 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB38P57729 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB38P57729 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB38P57729 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB38P57729 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB38P57729 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB38P57729 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB38P57729 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB38P57729 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB38P57729 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB38P57729 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB38P57729 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB38P57729 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB38P57729 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB38P57729 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB38P57729 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB38P57729 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB38P57729 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB38P57729 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB38P57729 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB38P57729 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB38P57729 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB38P57729 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB38P57729 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB38P57729 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB38P57729 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB38P57729 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB38P57729 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB38P57729 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB38P57729 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB38P57729 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB38P57729 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB38P57729 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB38P57729 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB38P57729 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB38P57729 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB38P57729 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB38P57729 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB38P57729 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB38P57729 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB38P57729 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB38P57729 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB38P57729 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB38P57729 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB38P57729 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB38P57729 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB38P57729 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB38P57729 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB38P57729 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB38P57729 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB38P57729 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB38P57729 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB38P57729 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB38P57729 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB38P57729 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB38P57729 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB38P57729 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB38P57729 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB38P57729 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB38P57729 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB38P57729 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB38P57729 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB38P57729 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB38P57729 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB38P57729 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB38P57729 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB38P57729 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB38P57729 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB38P57729 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB38P57729 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB38P57729 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB38P57729 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB38P57729 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB38P57729 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB38P57729 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB38P57729 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB38P57729 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms