Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AFDNP55196 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AFDNP55196 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
AFDNP55196 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AFDNP55196 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AFDNP55196 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
AFDNP55196 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFDNP55196 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFDNP55196 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFDNP55196 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFDNP55196 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFDNP55196 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AFDNP55196 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AFDNP55196 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AFDNP55196 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFDNP55196 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFDNP55196 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AFDNP55196 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFDNP55196 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFDNP55196 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFDNP55196 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFDNP55196 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFDNP55196 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFDNP55196 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFDNP55196 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AFDNP55196 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AFDNP55196 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFDNP55196 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AFDNP55196 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFDNP55196 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFDNP55196 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFDNP55196 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFDNP55196 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFDNP55196 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFDNP55196 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFDNP55196 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFDNP55196 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFDNP55196 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFDNP55196 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFDNP55196 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFDNP55196 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFDNP55196 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AFDNP55196 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
AFDNP55196 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFDNP55196 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AFDNP55196 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFDNP55196 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFDNP55196 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFDNP55196 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFDNP55196 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFDNP55196 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFDNP55196 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFDNP55196 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFDNP55196 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFDNP55196 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFDNP55196 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFDNP55196 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFDNP55196 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AFDNP55196 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AFDNP55196 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFDNP55196 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFDNP55196 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AFDNP55196 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFDNP55196 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFDNP55196 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFDNP55196 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFDNP55196 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFDNP55196 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AFDNP55196 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AFDNP55196 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AFDNP55196 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFDNP55196 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFDNP55196 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFDNP55196 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFDNP55196 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFDNP55196 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFDNP55196 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AFDNP55196 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFDNP55196 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFDNP55196 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFDNP55196 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFDNP55196 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFDNP55196 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFDNP55196 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFDNP55196 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFDNP55196 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFDNP55196 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFDNP55196 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFDNP55196 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFDNP55196 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFDNP55196 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFDNP55196 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFDNP55196 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFDNP55196 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFDNP55196 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFDNP55196 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AFDNP55196 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFDNP55196 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFDNP55196 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AFDNP55196 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms