Protein–RNA interactions for Protein: P53672

CRYBA2, Beta-crystallin A2, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA2P53672 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRYBA2P53672 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms