Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARFIP1P53367 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ARFIP1P53367 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms