Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms