Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RORCP51449 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RORCP51449 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RORCP51449 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RORCP51449 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RORCP51449 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RORCP51449 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RORCP51449 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RORCP51449 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RORCP51449 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORCP51449 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORCP51449 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORCP51449 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RORCP51449 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORCP51449 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORCP51449 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORCP51449 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORCP51449 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORCP51449 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RORCP51449 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RORCP51449 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORCP51449 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORCP51449 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORCP51449 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORCP51449 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORCP51449 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORCP51449 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RORCP51449 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORCP51449 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORCP51449 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORCP51449 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORCP51449 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RORCP51449 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORCP51449 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORCP51449 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORCP51449 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORCP51449 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORCP51449 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORCP51449 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORCP51449 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORCP51449 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORCP51449 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORCP51449 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORCP51449 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RORCP51449 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORCP51449 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORCP51449 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORCP51449 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORCP51449 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORCP51449 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORCP51449 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORCP51449 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORCP51449 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RORCP51449 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORCP51449 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORCP51449 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORCP51449 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORCP51449 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORCP51449 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RORCP51449 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORCP51449 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RORCP51449 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORCP51449 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORCP51449 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORCP51449 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORCP51449 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORCP51449 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORCP51449 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORCP51449 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORCP51449 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORCP51449 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORCP51449 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORCP51449 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORCP51449 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RORCP51449 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORCP51449 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms