Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAMP50895 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAMP50895 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAMP50895 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAMP50895 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAMP50895 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAMP50895 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAMP50895 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAMP50895 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAMP50895 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAMP50895 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAMP50895 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAMP50895 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAMP50895 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAMP50895 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAMP50895 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAMP50895 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BCAMP50895 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAMP50895 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAMP50895 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAMP50895 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAMP50895 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAMP50895 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAMP50895 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAMP50895 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAMP50895 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAMP50895 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAMP50895 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAMP50895 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAMP50895 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAMP50895 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAMP50895 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAMP50895 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAMP50895 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAMP50895 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAMP50895 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAMP50895 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAMP50895 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAMP50895 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BCAMP50895 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAMP50895 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAMP50895 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAMP50895 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAMP50895 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAMP50895 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAMP50895 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAMP50895 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAMP50895 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAMP50895 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAMP50895 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAMP50895 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAMP50895 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAMP50895 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAMP50895 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAMP50895 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAMP50895 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAMP50895 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAMP50895 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAMP50895 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAMP50895 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAMP50895 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAMP50895 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAMP50895 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAMP50895 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAMP50895 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAMP50895 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAMP50895 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAMP50895 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAMP50895 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BCAMP50895 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
BCAMP50895 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
BCAMP50895 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
BCAMP50895 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAMP50895 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAMP50895 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAMP50895 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAMP50895 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAMP50895 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAMP50895 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAMP50895 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAMP50895 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAMP50895 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAMP50895 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAMP50895 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAMP50895 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAMP50895 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAMP50895 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAMP50895 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAMP50895 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAMP50895 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAMP50895 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAMP50895 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAMP50895 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAMP50895 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAMP50895 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAMP50895 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAMP50895 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAMP50895 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAMP50895 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BCAMP50895 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms