Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSEN1P49768 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms