Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POU3F4P49335 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms