Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms